More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0062 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
352 aa  702  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  54.02 
 
 
328 aa  313  3e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  52.02 
 
 
328 aa  304  1e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  52.1 
 
 
343 aa  303  3e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  53.48 
 
 
352 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  55.59 
 
 
335 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50 
 
 
360 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.08 
 
 
385 aa  286  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  46.9 
 
 
389 aa  275  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  49.29 
 
 
340 aa  275  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.94 
 
 
324 aa  273  5e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  48.7 
 
 
369 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  48.18 
 
 
399 aa  265  9e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50861e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  51.52 
 
 
379 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  45.95 
 
 
396 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.91 
 
 
369 aa  259  5e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.65 
 
 
369 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  49.55 
 
 
368 aa  253  5e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.92 
 
 
361 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  45.29 
 
 
361 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  50 
 
 
386 aa  242  8e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  45.71 
 
 
369 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  43.66 
 
 
364 aa  232  7e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  39.36 
 
 
376 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  43.31 
 
 
398 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  43.44 
 
 
344 aa  221  1e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  40.74 
 
 
389 aa  201  2e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  41.29 
 
 
356 aa  190  3e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  39.42 
 
 
368 aa  190  3e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  40.58 
 
 
349 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.97 
 
 
356 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  40.97 
 
 
356 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.23 
 
 
367 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.77 
 
 
361 aa  179  5e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  39.83 
 
 
369 aa  174  3e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  59.12 
 
 
409 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  30.21 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  28.44 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  26.72 
 
 
384 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  27.22 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  26.07 
 
 
342 aa  81.6  2e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  26.48 
 
 
325 aa  79.3  1e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.78 
 
 
293 aa  77  4e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  44.23 
 
 
336 aa  76.3  7e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.78 
 
 
293 aa  76.3  8e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.88 
 
 
293 aa  75.5  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  29.84 
 
 
293 aa  74.3  3e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0812  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.27 
 
 
273 aa  73.9  4e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  29.96 
 
 
316 aa  71.6  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  38.81 
 
 
324 aa  71.6  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.42 
 
 
354 aa  70.9  3e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.01 
 
 
328 aa  70.9  4e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.48 
 
 
294 aa  70.5  4e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.25 
 
 
349 aa  68.9  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.74 
 
 
316 aa  69.3  1e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  26.99 
 
 
304 aa  68.6  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  29.26 
 
 
369 aa  68.2  2e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.64 
 
 
293 aa  68.6  2e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.86 
 
 
293 aa  67.4  3e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.03 
 
 
288 aa  67.8  3e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  27.53 
 
 
354 aa  67  4e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  26.99 
 
 
304 aa  66.6  6e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  24.5 
 
 
356 aa  66.2  8e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  24.5 
 
 
356 aa  66.2  8e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.19 
 
 
364 aa  65.9  1e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.12 
 
 
337 aa  65.5  1e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  25.77 
 
 
327 aa  65.5  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  23.78 
 
 
354 aa  65.1  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  25.26 
 
 
339 aa  64.3  3e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  27.78 
 
 
304 aa  64.3  3e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  19.53 
 
 
354 aa  64.3  3e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.39994e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  27.3 
 
 
819 aa  64.7  3e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.48 
 
 
364 aa  63.9  4e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  25.73 
 
 
371 aa  63.5  5e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0309  aminomethyl transferase family protein  24.89 
 
 
268 aa  60.8  3e-08  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  28.16 
 
 
1028 aa  60.8  3e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  25.58 
 
 
267 aa  60.5  4e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  28.4 
 
 
285 aa  60.5  5e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.87 
 
 
282 aa  60.1  5e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  23.68 
 
 
371 aa  60.1  6e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2267  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  22.5 
 
 
326 aa  59.7  7e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1013  folate-binding protein YgfZ  28.04 
 
 
284 aa  59.7  7e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  24.91 
 
 
291 aa  58.5  1e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  24.05 
 
 
371 aa  58.9  1e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  26.93 
 
 
372 aa  58.9  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.83 
 
 
309 aa  59.3  1e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  26.75 
 
 
367 aa  58.2  2e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  25.38 
 
 
348 aa  58.2  2e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
815 aa  58.2  2e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  29.07 
 
 
284 aa  58.2  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  20.35 
 
 
370 aa  57.8  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.96 
 
 
347 aa  57.8  3e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  32.61 
 
 
302 aa  57.8  3e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.02813e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.96 
 
 
955 aa  57.4  4e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0138  aminomethyl transferase family protein  23.68 
 
 
278 aa  57.4  4e-07  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  29.07 
 
 
284 aa  57  4e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.62 
 
 
963 aa  57  5e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2622  glycine cleavage T-protein barrel  24.9 
 
 
287 aa  56.6  7e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.17 
 
 
368 aa  56.2  8e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.65 
 
 
292 aa  56.2  8e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>