More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0048 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0048  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
405 aa  836  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.396103  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07140  D-mannonate dehydratase  68.41 
 
 
402 aa  583  1e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537507  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2883  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  65.01 
 
 
403 aa  562  1e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0617503  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1619  starvation-sensing protein RspA  64.27 
 
 
404 aa  562  1e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000210785  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01540  hypothetical protein  64.27 
 
 
404 aa  563  1e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2049  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.27 
 
 
404 aa  563  1e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.362051  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  65.17 
 
 
403 aa  562  1e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0553665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3563  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.52 
 
 
404 aa  562  1e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851149  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2062  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.27 
 
 
404 aa  563  1e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0579559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1788  starvation-sensing protein RspA  64.27 
 
 
404 aa  563  1e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1654  starvation-sensing protein RspA  64.27 
 
 
404 aa  563  1e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0315691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01550  predicted dehydratase  64.27 
 
 
404 aa  563  1e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.03 
 
 
404 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2635  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.03 
 
 
404 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0759429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0802  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.77 
 
 
404 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1036  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.02 
 
 
404 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4722  Galactonate dehydratase  65.42 
 
 
402 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44454  normal  0.932737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3561  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.76 
 
 
431 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1427  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.93 
 
 
403 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.93 
 
 
402 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4500  starvation sensing protein  62.53 
 
 
404 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.244455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.28 
 
 
404 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1162  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.11 
 
 
404 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1889  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.43 
 
 
402 aa  554  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0204033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1616  starvation sensing protein RspA  63.52 
 
 
404 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1667  starvation sensing protein RspA  63.52 
 
 
404 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1607  starvation sensing protein RspA  63.03 
 
 
404 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1834  starvation sensing protein RspA  63.28 
 
 
404 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.768737  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.67 
 
 
402 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1675  starvation sensing protein RspA  63.28 
 
 
404 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4132  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.55 
 
 
407 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0168136  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02420  D-mannonate dehydratase  64.09 
 
 
402 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296933  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3318  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.53 
 
 
411 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3978  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  63.28 
 
 
403 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1364  starvation sensing protein  61.69 
 
 
402 aa  541  1e-152  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.185612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1004  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.29 
 
 
403 aa  538  1e-152  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.123594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  64.09 
 
 
402 aa  538  1e-152  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  5.50231e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3278  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.53 
 
 
403 aa  540  1e-152  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1424  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme  61.69 
 
 
402 aa  541  1e-152  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2128  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.09 
 
 
402 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03854  starvation sensing protein  63.34 
 
 
419 aa  531  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0037  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.54 
 
 
403 aa  529  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4599  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.68 
 
 
402 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316488  normal  0.738385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1064  galactokinase  60.7 
 
 
402 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32364  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0766  starvation sensing protein RspA  62.94 
 
 
402 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2001  starvation sensing protein RspA  63.18 
 
 
402 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2096  starvation sensing protein RspA  63.18 
 
 
402 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0510  starvation sensing protein RspA  63.18 
 
 
402 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0790  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.07 
 
 
409 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1648  starvation sensing protein RspA  62.94 
 
 
402 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.21 
 
 
406 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.73485  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0583  starvation sensing protein RspA  62.94 
 
 
402 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0980874  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0694  starvation sensing protein RspA  62.94 
 
 
402 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.58786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2974  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  62.03 
 
 
403 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2983  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  60.1 
 
 
411 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0331585  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5132  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.94 
 
 
402 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03730  D-mannonate dehydratase  61.07 
 
 
411 aa  517  1e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3675  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  62.44 
 
 
402 aa  514  1e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468042  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2407  mandelate racemase/muconate-lactonizing protein  58.09 
 
 
409 aa  506  1e-142  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360808  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0504  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.33 
 
 
409 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4287  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.79 
 
 
405 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01410  D-mannonate dehydratase  56.8 
 
 
412 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  52.72 
 
 
423 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0398096  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.21 
 
 
412 aa  337  3e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.213701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0947  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.8 
 
 
417 aa  302  8e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1541  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, C- domain protein  39.29 
 
 
417 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.43 
 
 
415 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5328  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.81 
 
 
415 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.06 
 
 
399 aa  287  3e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1377  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.5 
 
 
438 aa  285  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0977  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.47 
 
 
399 aa  284  2e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  9.13378e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4410  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.31 
 
 
429 aa  283  5e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164749  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0192  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.91 
 
 
399 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1008  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.06 
 
 
450 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.570237  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3948  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.06 
 
 
451 aa  274  2e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4254  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.56 
 
 
399 aa  273  5e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.851358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4063  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.31 
 
 
399 aa  270  3e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0909  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.74 
 
 
433 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598164  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  32.91 
 
 
382 aa  200  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.32 
 
 
388 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  32.59 
 
 
384 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.72 
 
 
384 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  31.04 
 
 
382 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  31.04 
 
 
382 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.1 
 
 
382 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  29.8 
 
 
382 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  31.06 
 
 
382 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  31.06 
 
 
382 aa  185  1e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  30.41 
 
 
382 aa  185  1e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  31.06 
 
 
382 aa  185  1e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  30.41 
 
 
382 aa  185  1e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  31.06 
 
 
382 aa  185  2e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  29.93 
 
 
382 aa  184  2e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  29.8 
 
 
382 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  29.8 
 
 
382 aa  183  5e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.27 
 
 
382 aa  182  8e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  30.56 
 
 
502 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.48 
 
 
382 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  30.4 
 
 
382 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  30.4 
 
 
382 aa  180  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>