More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0977 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0977  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 399 aa  835    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000913378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4063  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  70.93 
 
 		 399 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4254  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  70.43 
 
 		 399 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.851358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0192  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.17 
 
 		 399 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.42 
 
 		 399 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5328  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.22 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.46 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1541  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, C- domain protein  46.04 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0947  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.56 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.74 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.213701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1008  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.32 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.570237  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3948  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.33 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1377  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.1 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4410  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.8 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0909  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.05 
 
 		 433 aa  309  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07140  D-mannonate dehydratase  39.8 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01410  D-mannonate dehydratase  37.56 
 
 		 412 aa  292  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4287  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.66 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4132  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.99 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0168136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.56 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3563  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.31 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0790  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.04 
 
 		 409 aa  289  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1036  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.31 
 
 		 404 aa  288  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0802  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.81 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1004  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.62 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.123594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2407  mandelate racemase/muconate-lactonizing protein  35.94 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3278  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.65 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.06 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1162  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.4 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2983  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.52 
 
 		 411 aa  286  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0331585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.65 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0553665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1889  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.86 
 
 		 402 aa  285  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0204033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0048  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.47 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.396103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03730  D-mannonate dehydratase  36.98 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0037  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.66 
 
 		 403 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2635  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.81 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0759429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01550  predicted dehydratase  38.06 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2062  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.06 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0579559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1619  starvation-sensing protein RspA  38.06 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000210785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1788  starvation-sensing protein RspA  38.06 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1654  starvation-sensing protein RspA  38.06 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0315691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01540  hypothetical protein  38.06 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4500  starvation sensing protein  37.69 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.244455  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2049  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.06 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.362051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1064  galactokinase  37.41 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2883  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.79 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0617503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2974  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  37.41 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.32 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3318  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.63 
 
 		 411 aa  280  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3561  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.8 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.04 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.73485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1667  starvation sensing protein RspA  37.56 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1675  starvation sensing protein RspA  37.31 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1834  starvation sensing protein RspA  37.31 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.768737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1616  starvation sensing protein RspA  37.31 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5132  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.06 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1607  starvation sensing protein RspA  37.06 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3978  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  38.28 
 
 		 403 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1427  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.4 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0504  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.68 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4722  Galactonate dehydratase  37.75 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44454  normal  0.932737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02420  D-mannonate dehydratase  35.89 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0510  starvation sensing protein RspA  38.56 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2096  starvation sensing protein RspA  38.56 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2001  starvation sensing protein RspA  38.56 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4599  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.81 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316488  normal  0.738385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.4 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000550231  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1364  starvation sensing protein  38.02 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.185612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1424  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme  38.02 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.81 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721451  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0766  starvation sensing protein RspA  38.06 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2128  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.82 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03854  starvation sensing protein  37.66 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0583  starvation sensing protein RspA  38.06 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0980874  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0694  starvation sensing protein RspA  38.06 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.58786  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1648  starvation sensing protein RspA  38.06 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  37.44 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0398096  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3675  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.57 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468042  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.25 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  29.77 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  29.78 
 
 		 384 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  29.77 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  30.93 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  31.61 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  28.25 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.19 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.84 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.76 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  27.46 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00121  galactonate dehydratase  28.46 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.11 
 
 		 381 aa  162  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  27.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  27.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  27.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  27.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  27.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.58 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  28.02 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>