56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1951 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  100 
 
 
268 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  58.38 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  59.45 
 
 
248 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  42.99 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  39.18 
 
 
217 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  46.59 
 
 
216 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  41.15 
 
 
238 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  42.51 
 
 
197 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  38.86 
 
 
280 aa  148  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  36.79 
 
 
230 aa  138  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  36.2 
 
 
871 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  47.83 
 
 
167 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  33.85 
 
 
231 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  39.89 
 
 
240 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  35.23 
 
 
207 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  40.44 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  32.29 
 
 
509 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  30.14 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  32.72 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  28 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  30.93 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  28.24 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  27.64 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  26.51 
 
 
447 aa  62  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  25.15 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  31.07 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  60.98 
 
 
48 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.22 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.68 
 
 
183 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  27.73 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  28.21 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  31.17 
 
 
269 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  24.89 
 
 
262 aa  55.5  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.53 
 
 
227 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  25.35 
 
 
152 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  28.92 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  30.64 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  25.62 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  29.73 
 
 
479 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  24.45 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  28.92 
 
 
275 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  24.83 
 
 
171 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  28.92 
 
 
286 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2158  lipolytic protein G-D-S-L family  29.01 
 
 
226 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  26.96 
 
 
372 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7062  lipolytic protein G-D-S-L family  27.91 
 
 
248 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  26.97 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  24.16 
 
 
429 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  23.67 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1651  GDSL family lipase  28.8 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  27.38 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  26.43 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  23.68 
 
 
228 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  23.39 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>