More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2179 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  100 
 
 
512 aa  1037    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  56.4 
 
 
502 aa  565  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  53.88 
 
 
518 aa  555  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  51.9 
 
 
500 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  55.35 
 
 
509 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  53.54 
 
 
509 aa  535  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  56.34 
 
 
504 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  52.61 
 
 
511 aa  530  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  55.6 
 
 
506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  51.31 
 
 
496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  51.81 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  49.8 
 
 
515 aa  488  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  51.82 
 
 
498 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  47.42 
 
 
501 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  49.9 
 
 
499 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  43.49 
 
 
509 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  51.41 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  41.7 
 
 
489 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  42.2 
 
 
499 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  40.6 
 
 
492 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  40.6 
 
 
492 aa  403  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  38.65 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  42.46 
 
 
511 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  40.97 
 
 
517 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  40.97 
 
 
517 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  40.28 
 
 
488 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  38.87 
 
 
503 aa  365  1e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  43.31 
 
 
483 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  42.86 
 
 
484 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  42.86 
 
 
484 aa  359  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  45.56 
 
 
492 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  42.66 
 
 
484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  42.66 
 
 
484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  42.66 
 
 
484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  44.73 
 
 
492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  40.32 
 
 
492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  42.66 
 
 
484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  42.45 
 
 
484 aa  356  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  43.31 
 
 
482 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  42.17 
 
 
484 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  42.17 
 
 
484 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  44.84 
 
 
499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  44.16 
 
 
492 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  43.96 
 
 
492 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  43.96 
 
 
492 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  35.87 
 
 
496 aa  349  7e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  41.05 
 
 
484 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  41.05 
 
 
484 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  40.85 
 
 
484 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  41.25 
 
 
484 aa  347  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  39.31 
 
 
490 aa  345  8.999999999999999e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  41.88 
 
 
491 aa  345  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  44.16 
 
 
496 aa  345  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  40.85 
 
 
484 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  41.92 
 
 
493 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  41.6 
 
 
485 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  43.7 
 
 
492 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  41.48 
 
 
485 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  39.44 
 
 
484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  41.85 
 
 
483 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  39.24 
 
 
484 aa  336  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  41.77 
 
 
486 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  39.03 
 
 
484 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  40.48 
 
 
493 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  41.08 
 
 
493 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  34.61 
 
 
503 aa  333  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  41.08 
 
 
493 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  41.28 
 
 
493 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  41.12 
 
 
508 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  39.96 
 
 
494 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  39.17 
 
 
486 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  41.08 
 
 
493 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  41.24 
 
 
493 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  41.24 
 
 
493 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  41.24 
 
 
493 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  40.32 
 
 
486 aa  329  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  39.16 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  39.96 
 
 
491 aa  326  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  38.72 
 
 
494 aa  325  8.000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  41.59 
 
 
488 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  39.51 
 
 
487 aa  324  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  37.55 
 
 
484 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  38.03 
 
 
489 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  37.63 
 
 
483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  37.63 
 
 
483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  37.95 
 
 
484 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  41.12 
 
 
485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  41.18 
 
 
486 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  37.18 
 
 
486 aa  319  6e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  41.18 
 
 
486 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  39.72 
 
 
501 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  38.83 
 
 
484 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  40.57 
 
 
481 aa  316  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  39.4 
 
 
481 aa  316  8e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  40.52 
 
 
472 aa  315  9e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  41.18 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  38.2 
 
 
530 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  41.18 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  41.18 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  41.18 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>