More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2604 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  100 
 
 
307 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
307 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  48.41 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  37.59 
 
 
280 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  37.93 
 
 
280 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
284 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  35.31 
 
 
283 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  36.96 
 
 
289 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  37.45 
 
 
287 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  37.45 
 
 
287 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  37.45 
 
 
287 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  36.29 
 
 
287 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
287 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  35.79 
 
 
287 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  35.91 
 
 
287 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  36.29 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  35.91 
 
 
287 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  36.47 
 
 
280 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  31.62 
 
 
312 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 
307 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.27 
 
 
307 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 
307 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 
307 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 
307 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 
307 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4660  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
307 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.58 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4645  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.58 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  30.93 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  38.73 
 
 
297 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.5 
 
 
293 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  31.7 
 
 
302 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  31.7 
 
 
302 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
307 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
301 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
301 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  37.74 
 
 
241 aa  136  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  33.33 
 
 
301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  31.75 
 
 
304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  33.18 
 
 
295 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.49 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.5 
 
 
293 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  29.21 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  31.07 
 
 
297 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  38.19 
 
 
308 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  37.02 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.81 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  34.58 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  31.55 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  32.08 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
295 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  30.73 
 
 
291 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  35.98 
 
 
295 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  32.05 
 
 
342 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  35.21 
 
 
303 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  29.04 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  30.79 
 
 
307 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.68 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33.33 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  30.82 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  32.89 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  32.3 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  33.82 
 
 
313 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 
294 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  30.74 
 
 
299 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  30.56 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.71 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.88 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  34.78 
 
 
284 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 
300 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  30.87 
 
 
332 aa  126  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  32.44 
 
 
295 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
300 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  28.42 
 
 
293 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  36.23 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  37.77 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 
293 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  33.94 
 
 
741 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  37.16 
 
 
284 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  31.82 
 
 
232 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  36.74 
 
 
317 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  33.89 
 
 
296 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  39.68 
 
 
250 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  36.55 
 
 
367 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  30.81 
 
 
313 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  31.08 
 
 
233 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.04 
 
 
312 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  34.98 
 
 
316 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
300 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  28.08 
 
 
293 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  28.42 
 
 
293 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  33.97 
 
 
315 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>