28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2856 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2960  PKD domain containing protein  71.74 
 
 		 687 aa  874    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2856  hypothetical protein  100 
 
 		 1117 aa  2175    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00658326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2763  hypothetical protein  96.24 
 
 		 1117 aa  1836    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2868  PKD domain containing protein  71.4 
 
 		 687 aa  873    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2973  PKD domain containing protein  49.91 
 
 		 586 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2881  PKD domain containing protein  50 
 
 		 588 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  44.05 
 
 		 1206 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  42.7 
 
 		 1236 aa  65.1  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  25.94 
 
 		 1771 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1128 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  45.33 
 
 		 1526 aa  51.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  43.21 
 
 		 652 aa  50.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  28.5 
 
 		 3066 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  39.58 
 
 		 514 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5086  hypothetical protein  34.55 
 
 		 421 aa  50.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  36.36 
 
 		 1302 aa  50.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  33.58 
 
 		 446 aa  49.7  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.28 
 
 		 456 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.42 
 
 		 1066 aa  49.3  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  38 
 
 		 599 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  42.31 
 
 		 551 aa  47  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.01 
 
 		 2031 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.68 
 
 		 428 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.87 
 
 		 639 aa  45.8  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.58 
 
 		 500 aa  45.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  38.24 
 
 		 793 aa  45.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  37.23 
 
 		 943 aa  44.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  25.73 
 
 		 563 aa  44.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>