More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2771 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  100 
 
 
212 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  97.17 
 
 
212 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  92.45 
 
 
212 aa  219  2e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  36.65 
 
 
183 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  33.5 
 
 
205 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  36.73 
 
 
199 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  32.75 
 
 
189 aa  101  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  33.73 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  35.9 
 
 
200 aa  94.7  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  41.04 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  30.43 
 
 
344 aa  91.7  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  40.24 
 
 
181 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.15 
 
 
159 aa  84  1e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32.7 
 
 
164 aa  84.7  1e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.15 
 
 
159 aa  84.3  1e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.07 
 
 
164 aa  82.8  3e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.07 
 
 
164 aa  82.8  3e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  30.08 
 
 
154 aa  82.4  4e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.15 
 
 
159 aa  82  6e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.15 
 
 
159 aa  81.6  7e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  80.9  1e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
159 aa  80.9  1e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  80.9  1e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  80.9  1e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.09 
 
 
161 aa  80.1  2e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 
164 aa  80.1  2e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30.51 
 
 
159 aa  80.5  2e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 
163 aa  80.5  2e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.61 
 
 
159 aa  80.5  2e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  79.7  3e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.68 
 
 
164 aa  79.7  3e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  32.93 
 
 
325 aa  79.7  3e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.68 
 
 
164 aa  79.7  3e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.68 
 
 
164 aa  79.7  3e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.61 
 
 
164 aa  79.7  3e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.68 
 
 
164 aa  79.7  3e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.54 
 
 
164 aa  79.3  4e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.54 
 
 
164 aa  79.3  4e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  33.58 
 
 
164 aa  79.3  4e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.33 
 
 
163 aa  79.3  4e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.33 
 
 
161 aa  79.3  4e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.54 
 
 
164 aa  79.3  4e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.54 
 
 
164 aa  79.3  4e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  32.86 
 
 
182 aa  78.6  6e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.03 
 
 
165 aa  78.6  6e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.88 
 
 
163 aa  78.6  6e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  31.45 
 
 
145 aa  77.8  1e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  31.03 
 
 
164 aa  77.4  1e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.59 
 
 
164 aa  76.6  2e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  35.16 
 
 
163 aa  77  2e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.58 
 
 
183 aa  77  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  33.17 
 
 
211 aa  77.4  2e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  40.17 
 
 
179 aa  75.9  4e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  26.53 
 
 
149 aa  75.5  6e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.89 
 
 
161 aa  75.1  7e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  35.97 
 
 
177 aa  75.1  8e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  32.14 
 
 
161 aa  74.7  9e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  32.84 
 
 
164 aa  74.3  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  36.5 
 
 
189 aa  74.7  1e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.09 
 
 
174 aa  74.3  1e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  32.84 
 
 
164 aa  74.3  1e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  74.7  1e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.82 
 
 
164 aa  73.9  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  41.59 
 
 
152 aa  73.6  2e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.03 
 
 
162 aa  73.6  2e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  38.65 
 
 
182 aa  73.9  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.82 
 
 
164 aa  73.9  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.17 
 
 
157 aa  73.9  2e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 
313 aa  73.2  3e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  39.32 
 
 
179 aa  73.2  3e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  39.32 
 
 
179 aa  73.2  3e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  31.34 
 
 
163 aa  73.2  3e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  35.97 
 
 
177 aa  72.8  3e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.34 
 
 
164 aa  72.4  5e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.5 
 
 
168 aa  72.4  5e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  31.16 
 
 
162 aa  72  6e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  31.16 
 
 
162 aa  72  6e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  32.93 
 
 
568 aa  71.6  7e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  29.2 
 
 
163 aa  72  7e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  42.06 
 
 
185 aa  71.6  8e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  29.05 
 
 
164 aa  70.9  1e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  35.77 
 
 
185 aa  71.2  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  29.05 
 
 
170 aa  70.9  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  26.47 
 
 
167 aa  70.9  1e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  29.05 
 
 
164 aa  70.9  1e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  24.37 
 
 
170 aa  70.9  1e-11  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  30.36 
 
 
342 aa  71.2  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  28.85 
 
 
166 aa  70.9  1e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  29.05 
 
 
165 aa  70.5  2e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  28.23 
 
 
170 aa  70.1  2e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  28.23 
 
 
176 aa  70.1  2e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  37.9 
 
 
167 aa  70.5  2e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  26.59 
 
 
178 aa  70.5  2e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.74 
 
 
170 aa  70.5  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  33.79 
 
 
170 aa  69.7  3e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  35.29 
 
 
184 aa  69.7  3e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  29.57 
 
 
183 aa  68.9  5e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  33.79 
 
 
170 aa  68.9  5e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  28.22 
 
 
165 aa  68.9  5e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  28.89 
 
 
178 aa  68.9  6e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>