96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2638 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2638  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  507  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2508  hypothetical protein  96.3 
 
 
243 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4252  M15D family D-Ala-D-Ala dipeptidase VanX  48.02 
 
 
268 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4186  M15D family D-Ala-D-Ala dipeptidase VanX  48.02 
 
 
268 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4413  M15D family D-Ala-D-Ala dipeptidase VanX  47.58 
 
 
264 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548196  normal  0.375083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1561  Svh  47.77 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0509  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.34 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1717  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  47.77 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1714  hypothetical protein  47.77 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4724  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  47.79 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1742  periplasmic dipeptidase  47.77 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0077  D-Ala-D-Ala dipeptidase  41.95 
 
 
231 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.033757  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0763  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  43.69 
 
 
224 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.0376933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0800  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  42.26 
 
 
220 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0574053  normal  0.256235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25870  D-Ala-D-Ala dipeptidase vanX  42.66 
 
 
254 aa  185  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0840  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  43.6 
 
 
220 aa  184  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.593673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0653  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  39.33 
 
 
265 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1779  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  46.7 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5792  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.44 
 
 
202 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1415  D-Ala-D-Ala dipeptidase  38.36 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3026  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  36.44 
 
 
238 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2426  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.55 
 
 
250 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0429393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5357  D-Ala-D-Ala dipeptidase  36.07 
 
 
202 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395884  normal  0.146315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2119  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  39.05 
 
 
222 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7136  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.44 
 
 
216 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04244  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.63 
 
 
248 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0522  D-Ala-D-Ala dipeptidase  36.99 
 
 
210 aa  155  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2248  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.34 
 
 
259 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1661  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.16 
 
 
202 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0344  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.83 
 
 
237 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1206  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.22 
 
 
227 aa  151  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1627  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.95 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4601  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.13 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2133  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.09 
 
 
200 aa  87  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11948  probable peptidase  29.3 
 
 
196 aa  85.9  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1272  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.25 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5181  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.84 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0835  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.77 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0247724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1254  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.65 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1902  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.56 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4003  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.17 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1575  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.14 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169844  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6300  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.08 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4478  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.84 
 
 
187 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129576  normal  0.531812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3778  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.6 
 
 
187 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4590  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.6 
 
 
187 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.977073  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5715  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.6 
 
 
187 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4016  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.84 
 
 
187 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568092  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4059  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.17 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4285  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.14 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1441  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.21 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.494405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2745  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.5 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791278  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1785  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.65 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0051  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.73 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1393  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.69 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0694639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2563  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.69 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0246  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.69 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1273  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.69 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327296  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1051  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.69 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1312  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.69 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0517  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.69 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1987  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.64 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2346  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.12 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0198  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.04 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1410  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.48 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10856  lipoprotein lpqR  26.75 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000511773  hitchhiker  0.0000000769937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1685  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.98 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3562  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.63 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2100  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.47 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01458  hypothetical protein  25.47 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2159  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.47 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2169  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.47 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159114  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1677  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.47 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01446  D-ala-D-ala dipeptidase, Zn-dependent  25.47 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3762  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.28 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.553521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1573  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.94 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1751  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2615  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.44 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2827  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.57 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159647  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1343  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.31 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4116  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.23 
 
 
190 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4461  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.7 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0087  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1654  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  24.22 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.52906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4557  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  27.17 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2196  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  25.75 
 
 
214 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348263  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0765  D-ala-D-ala dipeptidase  23.56 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.667505  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1391  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  21.47 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08171  D-ala-D-ala dipeptidase  22.11 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0214  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.23 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0532719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1425  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  21.47 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511324  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3555  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.14 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4812  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.14 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5471  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.14 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0406777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2451  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.76 
 
 
230 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1551  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  26.42 
 
 
252 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>