92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1714 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1714  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1561  Svh  98.83 
 
 		 256 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1742  periplasmic dipeptidase  99.22 
 
 		 256 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1717  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  97.66 
 
 		 256 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1779  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  97.84 
 
 		 309 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4413  M15D family D-Ala-D-Ala dipeptidase VanX  51.34 
 
 		 264 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548196  normal  0.375083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4252  M15D family D-Ala-D-Ala dipeptidase VanX  50.89 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4186  M15D family D-Ala-D-Ala dipeptidase VanX  50.89 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4724  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  50.89 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0509  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  51.79 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0077  D-Ala-D-Ala dipeptidase  47.2 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.033757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2508  hypothetical protein  44.84 
 
 		 243 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2638  hypothetical protein  44.44 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25870  D-Ala-D-Ala dipeptidase vanX  45.54 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0653  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  43.24 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0763  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  45.33 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.0376933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0840  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  47.3 
 
 		 220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.593673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0800  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  47.3 
 
 		 220 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0574053  normal  0.256235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2248  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  40.71 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3026  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  40.09 
 
 		 238 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2426  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  39.21 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0429393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0344  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  40.27 
 
 		 237 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5792  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.1 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04244  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  39.09 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1206  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  41.07 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2119  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  39.34 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0522  D-Ala-D-Ala dipeptidase  36.65 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1661  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.39 
 
 		 202 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1415  D-Ala-D-Ala dipeptidase  34.68 
 
 		 213 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1627  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.43 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7136  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  36.2 
 
 		 216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5357  D-Ala-D-Ala dipeptidase  33.94 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395884  normal  0.146315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1902  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.91 
 
 		 404 aa  99.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4590  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.49 
 
 		 187 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.977073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3778  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.49 
 
 		 187 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5715  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.49 
 
 		 187 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4478  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.97 
 
 		 187 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129576  normal  0.531812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1785  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 187 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4016  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.49 
 
 		 187 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1254  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.98 
 
 		 187 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6300  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 187 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5181  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.87 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4003  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.85 
 
 		 188 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1987  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.01 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0198  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.58 
 
 		 203 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2169  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.99 
 
 		 193 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01458  hypothetical protein  28.99 
 
 		 193 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2159  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.99 
 
 		 193 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2100  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.99 
 
 		 193 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4059  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.98 
 
 		 187 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1441  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 189 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.494405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2745  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.83 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3562  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.95 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1677  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.99 
 
 		 193 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01446  D-ala-D-ala dipeptidase, Zn-dependent  28.99 
 
 		 193 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1751  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.5 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1272  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.6 
 
 		 216 aa  86.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2133  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.75 
 
 		 200 aa  85.9  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2615  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.88 
 
 		 212 aa  85.5  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1573  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.5 
 
 		 193 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1685  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.99 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0051  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.92 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1410  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.82 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1575  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.63 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169844  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0246  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620144  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2563  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1273  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0517  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1393  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0694639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1312  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1051  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.04 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4601  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.79 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0835  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.71 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0247724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2346  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.61 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2827  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.19 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3762  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.16 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.553521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4461  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.46 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11948  probable peptidase  26.22 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10856  lipoprotein lpqR  27.16 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000511773  hitchhiker  0.0000000769937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4285  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.27 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2451  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.37 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1343  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.44 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4116  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.02 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_002950  PG1654  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  24.37 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.52906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4557  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3149  putative D-alanyl-d-alanine dipeptidase  27.51 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00328956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1391  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  25.15 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1425  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.04 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0087  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.73 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2448  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.98 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0432  D-alanyl-D-alanine dipeptidase-like  29.01 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34989  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0787  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.87 
 
 		 234 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>