28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1084 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  96.16 
 
 		 391 aa  699    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  95.66 
 
 		 391 aa  699    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  95.66 
 
 		 391 aa  699    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  96.16 
 
 		 391 aa  699    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  98.92 
 
 		 391 aa  739    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  778    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  34.3 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  28.83 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  28.83 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  31 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  33.33 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  28.95 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  29.96 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  28.76 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  30.77 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  29.31 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  27.48 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  27.48 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  27.48 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1988  hypothetical protein  27.14 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  24.14 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  24.14 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  23.85 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008500  STER_A3  transcriptional regulator  24.81 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  22.57 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  24.22 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000148  RstA phage-related replication protein  24.18 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1756  replication initiation factor  22.26 
 
 		 345 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>