19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2103 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  100 
 
 		 368 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  66.49 
 
 		 364 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  31.85 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  29.14 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  32.2 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  32.77 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  27.38 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  32 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  32 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  28.76 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  28.76 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  26.47 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  26.47 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  26.47 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  26.47 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  27.17 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  25.3 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  25.3 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  25.3 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>