24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2973 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  100 
 
 
371 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  30.25 
 
 
364 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  31.85 
 
 
368 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  33.69 
 
 
365 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  39.71 
 
 
341 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  36.82 
 
 
380 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  28.43 
 
 
477 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  28.43 
 
 
477 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  34.5 
 
 
304 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  31.85 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  29.31 
 
 
391 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  29.31 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  35.34 
 
 
391 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  35.34 
 
 
391 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  35.34 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  35.34 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000148  RstA phage-related replication protein  29.92 
 
 
382 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  26.51 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  25.3 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  26.75 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  26.75 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  26.75 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  29.56 
 
 
398 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4029  replication initiation factor  22.73 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>