22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2390 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  100 
 
 		 341 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  40.91 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  32.43 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  39.71 
 
 		 371 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  33.05 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  32.77 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  27.68 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  27.68 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  28.97 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  30.32 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  26.69 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  26.69 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  26.69 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  30.77 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  30.8 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  31.2 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  31.2 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  31.2 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  31.2 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  30.13 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  27.97 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  27.97 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>