25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1069 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  100 
 
 		 359 aa  748    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  100 
 
 		 359 aa  748    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  100 
 
 		 359 aa  748    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  38.17 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  36.83 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000148  RstA phage-related replication protein  35.48 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  36.99 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  36.99 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  33.16 
 
 		 398 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  26.69 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  27.75 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  27.07 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  27.48 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  27.48 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  27.65 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  26.75 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  27.48 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  27.48 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  27.48 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  27.48 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  27.71 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  28.31 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  28.31 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  25.3 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1756  replication initiation factor  25.99 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>