22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1756 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1756  replication initiation factor  100 
 
 
345 aa  726    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1988  hypothetical protein  27.91 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2114  hypothetical protein  27.49 
 
 
342 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00301162  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4029  replication initiation factor  27.54 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008500  STER_A3  transcriptional regulator  25.52 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0001  replication initiation factor  26.91 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727378  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0932  Tn916, transcriptional regulator, putative  23.42 
 
 
401 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2017  Cro/CI family transcriptional regulator  20.6 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.744887  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000148  RstA phage-related replication protein  28.1 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  25.65 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  25.65 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  27.27 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1566  replication initiation factor  24.86 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1577  replication initiation factor  24.86 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1588  replication initiation factor  24.86 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  25.99 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  25.99 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  27.63 
 
 
381 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  25.99 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  22.26 
 
 
382 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  22.26 
 
 
391 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1044  transcriptional regulator  24.49 
 
 
542 aa  42.7  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>