21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02310 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000148  RstA phage-related replication protein  91.62 
 
 
382 aa  743    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  97.38 
 
 
381 aa  781    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  51.25 
 
 
415 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  51.25 
 
 
415 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  38.17 
 
 
359 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  38.17 
 
 
359 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  38.17 
 
 
359 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  35.11 
 
 
398 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  26.51 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  24.9 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  26.56 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  26.56 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1756  replication initiation factor  27.27 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  27.64 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  22.57 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  22.5 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  31.33 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  31.33 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  31.33 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  31.33 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>