25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0367 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  100 
 
 		 477 aa  986    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  100 
 
 		 477 aa  986    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  32.02 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  28.34 
 
 		 365 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  28.43 
 
 		 371 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  27.68 
 
 		 341 aa  98.2  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  28.83 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  28.83 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  28.47 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  28.47 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  28.47 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  28.47 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  28.85 
 
 		 364 aa  87.4  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  32 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  27.44 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  25.49 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  29.48 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  29.48 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  28.31 
 
 		 359 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  28.31 
 
 		 359 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  28.31 
 
 		 359 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  27.14 
 
 		 420 aa  50.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000148  RstA phage-related replication protein  27.94 
 
 		 382 aa  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  27.23 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  26.53 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>