22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1705 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  100 
 
 		 398 aa  832    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  35.11 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  35.11 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  33.16 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  33.16 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  33.16 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000148  RstA phage-related replication protein  39.81 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  33.33 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  33.33 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  28.97 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  25.49 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  25.49 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  24.06 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  23.19 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  23.99 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  23.99 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  23.99 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  23.99 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  23.85 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  29.56 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  23.6 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  24.31 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>