17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2407 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  100 
 
 		 420 aa  865    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  27.94 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  31.85 
 
 		 371 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  27.38 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  29.88 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  30.07 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  29.96 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  28.73 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  28.73 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  28.73 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  28.73 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  33.78 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  30.13 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  27.47 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  27.14 
 
 		 477 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  27.14 
 
 		 477 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1705  replication initiation factor family protein  24.31 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>