26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00564 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  100 
 
 		 304 aa  634    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  34.3 
 
 		 382 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  35.09 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  34.8 
 
 		 391 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  34.8 
 
 		 391 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  34.8 
 
 		 391 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  34.8 
 
 		 391 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  30.62 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  34.5 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  32.3 
 
 		 365 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  27.44 
 
 		 477 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  27.44 
 
 		 477 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  30.32 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  27.17 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  28.04 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  27.47 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  27.65 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  27.65 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  27.65 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1988  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05778  hypothetical protein  28 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02310  hypothetical protein  27.64 
 
 		 381 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2114  hypothetical protein  23.53 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00301162  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0631  phage replication and integration protein  25.7 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0634  phage replication protein  25.7 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0001  replication initiation factor  24.88 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>