15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1988 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1988  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  712    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2114  hypothetical protein  59.06 
 
 		 342 aa  435  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00301162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1756  replication initiation factor  27.91 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0932  Tn916, transcriptional regulator, putative  27.94 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008500  STER_A3  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4029  replication initiation factor  23.77 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0001  replication initiation factor  23.77 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727378  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  27.14 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  27.14 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  27.14 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  27.14 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  25 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  27.14 
 
 		 391 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  27.14 
 
 		 391 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2017  Cro/CI family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 429 aa  46.2  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.744887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>