218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2180 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
304 aa  614  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.18 
 
 
295 aa  305  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0503  hypothetical protein  56.64 
 
 
252 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.55 
 
 
252 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29194  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3368  HupH hydrogenase expression protein  52.56 
 
 
245 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536952  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3105  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.21 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937161  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50520  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein, HoxR  72.86 
 
 
72 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0418213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1967  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.56 
 
 
80 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.923056  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3968  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1288  hypothetical protein  45 
 
 
158 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159615  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7258  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.25 
 
 
226 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  0.45859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4094  hypothetical protein  42.02 
 
 
165 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.15 
 
 
74 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1289  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.69 
 
 
76 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0226213  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3981  HupJ protein  45.38 
 
 
156 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1803  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  58.93 
 
 
353 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.080124  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  58.93 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1645  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  58.93 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  58.93 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2498  hypothetical protein  33.66 
 
 
215 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.679047  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  58.93 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1171  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  43.59 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2021  hypothetical protein  35.4 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3764  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  47.25 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2818  hypothetical protein  40.18 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1163  HupJ protein  46.15 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0481257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1966  hypothetical protein  39.45 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.45855  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.93 
 
 
65 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50510  hydrogenase expression/formation protein HoxT  37.67 
 
 
153 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.024437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2529  hydrogenase 2-specific chaperone  32.41 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2004  hydrogenase expression/formation  36.89 
 
 
167 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3982  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.25 
 
 
66 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2003  rubredoxin  50 
 
 
69 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165789  normal  0.805568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1415  hydrogenase 2-specific chaperone  30.3 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1170  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.7 
 
 
70 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1162  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.56 
 
 
70 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0573132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3318  hydrogenase 2-specific chaperone  29 
 
 
162 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3327  hydrogenase 2-specific chaperone  29 
 
 
162 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.861923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3493  hydrogenase 2-specific chaperone  29 
 
 
162 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3392  hydrogenase 2-specific chaperone  29 
 
 
162 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3765  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.85 
 
 
70 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
114 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
110 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3398  hydrogenase 2-specific chaperone  28 
 
 
162 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.28 
 
 
227 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  44.64 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  42.86 
 
 
589 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
53 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  48.94 
 
 
138 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
115 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4304  hydrogenase 2-specific chaperone  28 
 
 
162 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270108  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3278  hydrogenase 2-specific chaperone  28 
 
 
162 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3172  hydrogenase 2-specific chaperone  27.36 
 
 
162 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02868  hydrogenase 2-specific chaperone  28 
 
 
162 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0704  hydrogenase-2 operon protein HybE  28 
 
 
162 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3461  hydrogenase 2-specific chaperone  28 
 
 
162 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0701  hydrogenase 2-specific chaperone  28 
 
 
162 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02817  hypothetical protein  28 
 
 
162 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3419  hydrogenase 2-specific chaperone  28 
 
 
162 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.04 
 
 
591 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
63 aa  55.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
115 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
115 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 
113 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
53 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  54.35 
 
 
237 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25271  putative rubredoxin  48 
 
 
142 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
52 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
52 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
59 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0886  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.92 
 
 
57 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
58 aa  52.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1473  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  52.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1551  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 
50 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582708 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1472  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 
52 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  50 
 
 
53 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0229  rubredoxin  53.49 
 
 
162 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
53 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1857  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
111 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0202  rubredoxin  53.49 
 
 
139 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107628  normal  0.260868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
60 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
52 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
70 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
60 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
53 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1534  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
69 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477082  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
52 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
62 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
52 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  41.67 
 
 
67 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
51 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  41.67 
 
 
67 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  41.67 
 
 
67 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  41.67 
 
 
67 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
60 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>