267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1157 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.66 
 
 
304 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.35 
 
 
252 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29194  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0503  hypothetical protein  47.93 
 
 
252 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3105  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.96 
 
 
283 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937161  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3368  HupH hydrogenase expression protein  44.58 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536952  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1967  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  71.23 
 
 
80 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.923056  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50520  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein, HoxR  73.53 
 
 
72 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0418213  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7258  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  29.6 
 
 
226 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  0.45859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.15 
 
 
74 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1289  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.05 
 
 
76 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0226213  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3968  hypothetical protein  32.39 
 
 
183 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4094  hypothetical protein  31.18 
 
 
165 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1288  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159615  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1803  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  53.7 
 
 
353 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.080124  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1645  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  53.7 
 
 
353 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  54.72 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  54.72 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
65 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  54.72 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1171  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  35.37 
 
 
176 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2021  hypothetical protein  32.37 
 
 
153 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3981  HupJ protein  35.53 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3982  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.41 
 
 
66 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2004  hydrogenase expression/formation  34.11 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3764  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  40 
 
 
179 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2529  hydrogenase 2-specific chaperone  31.85 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2003  rubredoxin  52.38 
 
 
69 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165789  normal  0.805568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1415  hydrogenase 2-specific chaperone  29.63 
 
 
158 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3398  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2498  hypothetical protein  32.62 
 
 
215 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.679047  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1163  HupJ protein  32.12 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0481257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3327  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.861923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3318  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3392  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3493  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2818  hypothetical protein  33.15 
 
 
230 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.62 
 
 
115 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.27 
 
 
113 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.62 
 
 
115 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
63 aa  63.2  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4304  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270108  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02868  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0704  hydrogenase-2 operon protein HybE  26.63 
 
 
162 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3419  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02817  hypothetical protein  26.63 
 
 
162 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0701  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3461  hydrogenase 2-specific chaperone  26.63 
 
 
162 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.33 
 
 
53 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1966  hypothetical protein  31.87 
 
 
180 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.45855  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
110 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50510  hydrogenase expression/formation protein HoxT  34.04 
 
 
153 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.024437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3278  hydrogenase 2-specific chaperone  27.17 
 
 
162 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3172  hydrogenase 2-specific chaperone  26.09 
 
 
162 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  48.89 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.31 
 
 
591 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.82 
 
 
115 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0615  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 
52 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1170  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.77 
 
 
70 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
114 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  51.06 
 
 
51 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.67 
 
 
227 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.75 
 
 
589 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25271  putative rubredoxin  43.86 
 
 
142 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
54 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 
53 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
51 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  36.36 
 
 
138 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  54.35 
 
 
53 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  50 
 
 
53 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2368  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 
75 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.589579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
53 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3765  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.06 
 
 
70 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
54 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.68 
 
 
476 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.11 
 
 
52 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  46.81 
 
 
52 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0782  rubredoxin  50 
 
 
53 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
52 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0286  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.66 
 
 
75 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.27 
 
 
52 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
53 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
53 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
52 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
52 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  46.81 
 
 
105 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0689  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
75 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
53 aa  52.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1162  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
70 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0573132  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.94 
 
 
54 aa  52.8  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
52 aa  52.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
53 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  47.73 
 
 
53 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9570  predicted protein  44.44 
 
 
93 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99715  normal  0.0887132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2107  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
62 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2063  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.38 
 
 
494 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
58 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>