251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25271 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_25271  putative rubredoxin  100 
 
 
142 aa  292  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0229  rubredoxin  70.45 
 
 
162 aa  200  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0202  rubredoxin  65.22 
 
 
139 aa  195  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107628  normal  0.260868 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03191  putative rubredoxin  53.47 
 
 
142 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1661  putative rubredoxin  51.45 
 
 
141 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.250316  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03751  putative rubredoxin  51.45 
 
 
141 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.621583  normal  0.139947 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03211  putative rubredoxin  51.72 
 
 
144 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03181  putative rubredoxin  50.69 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03281  putative rubredoxin  51.01 
 
 
142 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 
115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0297  putative rubredoxin  49.31 
 
 
142 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.8 
 
 
114 aa  137  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  49.65 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1857  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.66 
 
 
111 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.98 
 
 
115 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.98 
 
 
115 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.76 
 
 
113 aa  133  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.55 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9570  predicted protein  43.75 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99715  normal  0.0887132 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16606  predicted protein  44.23 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.66 
 
 
227 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  50 
 
 
589 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.86 
 
 
295 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  40.3 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
53 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1534  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477082  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
60 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
304 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
53 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
52 aa  52.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
53 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.51 
 
 
53 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.51 
 
 
53 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
52 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0886  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
62 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
52 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.02 
 
 
52 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
52 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
52 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1967  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.923056  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
63 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
52 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
53 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0286  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.33 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  46.94 
 
 
53 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
52 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
52 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1342  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.78 
 
 
54 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  37.93 
 
 
237 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.51 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1473  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.86 
 
 
58 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
53 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
52 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 
52 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2021  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
54 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000050094  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1472  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2749  rubredoxin  47.06 
 
 
51 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.66 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
444 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
52 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  45.1 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0689  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.62 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 
53 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1551  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
50 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  45.45 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  42 
 
 
52 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 
284 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2013  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  40 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.78 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  38.46 
 
 
56 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1311  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
54 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  40 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  39.58 
 
 
237 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.22 
 
 
53 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  40 
 
 
56 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  40 
 
 
56 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
56 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
65 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  40 
 
 
56 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  40 
 
 
56 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
70 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
70 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
70 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  40 
 
 
56 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>