220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0202 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0202  rubredoxin  100 
 
 
139 aa  285  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107628  normal  0.260868 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0229  rubredoxin  72.9 
 
 
162 aa  226  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25271  putative rubredoxin  65.22 
 
 
142 aa  195  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1661  putative rubredoxin  60 
 
 
141 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.250316  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03751  putative rubredoxin  60 
 
 
141 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.621583  normal  0.139947 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03211  putative rubredoxin  56.3 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03181  putative rubredoxin  47.14 
 
 
142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.39 
 
 
115 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.39 
 
 
115 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03191  putative rubredoxin  60.4 
 
 
142 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 
114 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1857  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63 
 
 
111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0297  putative rubredoxin  60.4 
 
 
142 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  50.36 
 
 
138 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03281  putative rubredoxin  49.28 
 
 
142 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.95 
 
 
113 aa  129  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.36 
 
 
115 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9570  predicted protein  40.62 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99715  normal  0.0887132 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16606  predicted protein  40.38 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
227 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  45 
 
 
589 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
60 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.1 
 
 
53 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.65 
 
 
195 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1967  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.923056  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.52 
 
 
53 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  34.94 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  52  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
52 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1342  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.66 
 
 
54 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0689  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
75 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0286  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 
52 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.94 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.49 
 
 
304 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
51 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1472  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.1 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
52 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  35.29 
 
 
237 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.54 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  43.14 
 
 
229 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
54 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0886  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.76 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1473  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2368  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.43 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.589579 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
52 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.98 
 
 
476 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
295 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
53 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.86 
 
 
235 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  50 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.66 
 
 
52 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1534  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.98 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477082  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
56 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2021  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
54 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000050094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  43.14 
 
 
51 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.22 
 
 
53 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.38 
 
 
53 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.1 
 
 
52 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.66 
 
 
52 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 
52 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.49 
 
 
237 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2013  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
56 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.49 
 
 
237 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
52 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3194  rubredoxin  42 
 
 
52 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1311  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
128 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
52 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2245  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.66 
 
 
57 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0270478  normal  0.0358856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1254  rubredoxin  40 
 
 
56 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  33.82 
 
 
243 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.5 
 
 
455 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.22 
 
 
127 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
56 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2644  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.75 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0615  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.92 
 
 
52 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  50 
 
 
53 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2749  rubredoxin  45.1 
 
 
51 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 
53 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
52 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
58 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.62 
 
 
53 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  44 
 
 
52 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 
53 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>