84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03211 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_03211  putative rubredoxin  100 
 
 		 144 aa  297  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1661  putative rubredoxin  60 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.250316  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03751  putative rubredoxin  58.52 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.621583  normal  0.139947 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03181  putative rubredoxin  66.04 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03191  putative rubredoxin  66.04 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25271  putative rubredoxin  51.72 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03281  putative rubredoxin  66.04 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0297  putative rubredoxin  65.09 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0229  rubredoxin  51.75 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0202  rubredoxin  56.3 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107628  normal  0.260868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.43 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  40.97 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.55 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.55 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.47 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.49 
 
 		 114 aa  103  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1857  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16606  predicted protein  36.89 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9570  predicted protein  39.18 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99715  normal  0.0887132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  48.94 
 
 		 589 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  36.21 
 
 		 229 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  28.57 
 
 		 295 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.98 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 		 53 aa  50.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.34 
 
 		 304 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 53 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.59 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1967  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.94 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.923056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 		 53 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.22 
 
 		 53 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.34 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.1 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 		 52 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  34.57 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.22 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1240  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2013  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.74 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 		 444 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0286  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0562  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 		 195 aa  43.5  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.146358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2021  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000050094  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1971  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.95 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0689  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.22 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0886  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.22 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.6 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.25 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1289  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.5 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0226213  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.74 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  32.93 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.54 
 
 		 52 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.25 
 
 		 53 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 		 52 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 		 54 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.46 
 
 		 444 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.25 
 
 		 53 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 		 444 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2644  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.5 
 
 		 53 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2107  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.74 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  38.64 
 
 		 53 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.54 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.22 
 
 		 53 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1472  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.24 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  37.25 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2368  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.33 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.589579 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1342  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.9 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38 
 
 		 52 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.73 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.18 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  36.73 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.22 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2111  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.89 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0615  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.19 
 
 		 52 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.86 
 
 		 58 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.58 
 
 		 59 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602722 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 		 52 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>