143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1661 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1661  putative rubredoxin  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.250316  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03751  putative rubredoxin  97.87 
 
 
141 aa  279  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.621583  normal  0.139947 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03211  putative rubredoxin  60 
 
 
144 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0297  putative rubredoxin  76.24 
 
 
142 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0229  rubredoxin  61.82 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03281  putative rubredoxin  68.7 
 
 
142 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03181  putative rubredoxin  73.27 
 
 
142 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03191  putative rubredoxin  73.27 
 
 
142 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25271  putative rubredoxin  51.45 
 
 
142 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0202  rubredoxin  60 
 
 
139 aa  147  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107628  normal  0.260868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.48 
 
 
113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1179  rubredoxin  52 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1857  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.5 
 
 
111 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4149  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.58 
 
 
115 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4189  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.58 
 
 
115 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45545  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.52 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.51 
 
 
115 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2226  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.27 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.248438 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16606  predicted protein  36.27 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9570  predicted protein  35.42 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99715  normal  0.0887132 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.33 
 
 
53 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1967  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.89 
 
 
80 aa  50.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.923056  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0286  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.19 
 
 
75 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 
52 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.62 
 
 
53 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.76 
 
 
60 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.81 
 
 
227 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.22 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 
52 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  37.14 
 
 
238 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.78 
 
 
54 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.22 
 
 
295 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.18 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.34 
 
 
52 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1342  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.62 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  40.82 
 
 
53 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.5 
 
 
589 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.18 
 
 
53 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 
229 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 
53 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
52 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.22 
 
 
53 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
52 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2368  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.9 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.589579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  46.51 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
55 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.34 
 
 
304 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.51 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  40.91 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0332  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.24 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.24 
 
 
52 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.82 
 
 
493 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.78 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.51 
 
 
444 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  40 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.78 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0248  hypothetical protein  34.43 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0899608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.84 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.19 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
479 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.24 
 
 
52 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.91 
 
 
52 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0886  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.22 
 
 
57 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.03 
 
 
479 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1472  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
52 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.03 
 
 
479 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.03 
 
 
479 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.19 
 
 
52 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.91 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.03 
 
 
479 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  44.44 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0615  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.84 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  41.3 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  28.18 
 
 
455 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.02 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.5 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0689  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.9 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.22 
 
 
53 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.24 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.24 
 
 
444 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2013  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.34 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.03 
 
 
479 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
53 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  40 
 
 
494 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  31.03 
 
 
479 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.03 
 
 
479 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2644  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.24 
 
 
444 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.96 
 
 
479 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
53 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.03 
 
 
479 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.19 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
60 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.51 
 
 
53 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
52 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>