More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0248 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0248  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  147  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0899608 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.36 
 
 
480 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 
455 aa  71.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 
415 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  54.55 
 
 
477 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  47.27 
 
 
56 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  50.91 
 
 
461 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.82 
 
 
476 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3629  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
469 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  48.94 
 
 
591 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1804  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.27 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.839572  normal  0.255505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.56 
 
 
52 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.08 
 
 
53 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.87 
 
 
54 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
58 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.7 
 
 
52 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  57.5 
 
 
237 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  53.19 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.85 
 
 
61 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
51 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.789943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.77 
 
 
58 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  44.23 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  46.15 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.55 
 
 
179 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.35 
 
 
52 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
56 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.52 
 
 
53 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0101  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
52 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000330254  hitchhiker  1.93244e-16 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  50 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
56 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  57.5 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  61.54 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.54 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.35 
 
 
52 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  47.5 
 
 
229 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.54 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.76 
 
 
54 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  52.08 
 
 
52 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.43 
 
 
56 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
58 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
70 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
70 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
70 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
70 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.19 
 
 
58 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  48.15 
 
 
54 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.32 
 
 
54 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
52 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  57.5 
 
 
56 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.15 
 
 
54 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.38 
 
 
444 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
53 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.91 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.91 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.09 
 
 
55 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1443  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
52 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  50 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
60 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1444  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.64 
 
 
52 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  50 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0900  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.41 
 
 
57 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.837679 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  50 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0779  rubredoxin  55.32 
 
 
53 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000850619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0782  rubredoxin  52.08 
 
 
53 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0755  rubredoxin  55.32 
 
 
53 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000950456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  52.08 
 
 
53 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.5 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.91 
 
 
55 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  50 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 
53 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1052  rubredoxin  54.35 
 
 
52 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  50 
 
 
60 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  50 
 
 
60 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  47.17 
 
 
57 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
52 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.22 
 
 
445 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.97 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.09 
 
 
55 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.97 
 
 
56 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
53 aa  57.8  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
444 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
52 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>