21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1288 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1288  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159615  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1966  hypothetical protein  48.45 
 
 		 180 aa  130  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.45855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2818  hypothetical protein  45.96 
 
 		 230 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.76 
 
 		 304 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3105  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.7 
 
 		 283 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0503  hypothetical protein  43.08 
 
 		 252 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3368  HupH hydrogenase expression protein  43.65 
 
 		 245 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536952  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.08 
 
 		 252 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29194  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4094  hypothetical protein  37.33 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3981  HupJ protein  39.33 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.78 
 
 		 295 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3968  hypothetical protein  37.65 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1171  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  40.76 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1163  HupJ protein  47.42 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0481257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50510  hydrogenase expression/formation protein HoxT  35.42 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.024437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2498  hypothetical protein  32.82 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.679047  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3764  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  42.57 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2004  hydrogenase expression/formation  34.29 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2021  hypothetical protein  30.95 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7258  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  32.28 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  0.45859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2529  hydrogenase 2-specific chaperone  30.07 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>