21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2818 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2818  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1966  hypothetical protein  53.93 
 
 		 180 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.45855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1288  hypothetical protein  45.4 
 
 		 158 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159615  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3368  HupH hydrogenase expression protein  41.67 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536952  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3105  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.79 
 
 		 283 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0503  hypothetical protein  34.74 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.09 
 
 		 304 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.21 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29194  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1171  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  43.07 
 
 		 176 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4094  hypothetical protein  37.2 
 
 		 165 aa  85.1  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  30.47 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3981  HupJ protein  37.74 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1163  HupJ protein  40.29 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0481257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3764  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  41.12 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2004  hydrogenase expression/formation  39.13 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2498  hypothetical protein  31.85 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.679047  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50510  hydrogenase expression/formation protein HoxT  34.78 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.024437  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7258  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.87 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  0.45859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3968  hypothetical protein  30.13 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2021  hypothetical protein  29.94 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2529  hydrogenase 2-specific chaperone  28.16 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>