34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3278 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3278  hydrogenase 2-specific chaperone  100 
 
 		 162 aa  336  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0704  hydrogenase-2 operon protein HybE  99.38 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02817  hypothetical protein  99.38 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3419  hydrogenase 2-specific chaperone  99.38 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0701  hydrogenase 2-specific chaperone  99.38 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3461  hydrogenase 2-specific chaperone  99.38 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02868  hydrogenase 2-specific chaperone  99.38 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4304  hydrogenase 2-specific chaperone  98.77 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3172  hydrogenase 2-specific chaperone  98.77 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3398  hydrogenase 2-specific chaperone  79.63 
 
 		 162 aa  273  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3318  hydrogenase 2-specific chaperone  79.63 
 
 		 162 aa  272  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3327  hydrogenase 2-specific chaperone  79.63 
 
 		 162 aa  272  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.861923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3493  hydrogenase 2-specific chaperone  79.01 
 
 		 162 aa  271  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3392  hydrogenase 2-specific chaperone  79.01 
 
 		 162 aa  271  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2529  hydrogenase 2-specific chaperone  49.02 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1415  hydrogenase 2-specific chaperone  48.03 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3968  hypothetical protein  29.33 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3981  HupJ protein  33.77 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4094  hypothetical protein  32.61 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69293  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7258  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  29.2 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  0.45859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2004  hydrogenase expression/formation  32.99 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3105  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  29.25 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1157  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  27.17 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2021  hypothetical protein  25.68 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2180  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  27.72 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0673995  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1163  HupJ protein  33.33 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0481257  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3368  HupH hydrogenase expression protein  27.78 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536952  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1171  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  31.87 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3764  putative hydrogenase expression/formation protein HupJ  35.48 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0503  hypothetical protein  27.45 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  27.45 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29194  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50510  hydrogenase expression/formation protein HoxT  28.06 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.024437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2498  hypothetical protein  25.49 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.679047  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1966  hypothetical protein  26.74 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.45855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>