More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0135 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0135  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0546  50S ribosomal protein L27  72.41 
 
 
88 aa  127  6e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0487  50S ribosomal protein L27  71.26 
 
 
88 aa  125  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  67.03 
 
 
93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
90 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
89 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  62.22 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
90 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
89 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  62.22 
 
 
91 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
89 aa  105  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
89 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
89 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
90 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 
89 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
88 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0897  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
82 aa  104  5e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
89 aa  104  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
89 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
89 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
89 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
88 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
88 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
89 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
88 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
89 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
89 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
89 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  56.67 
 
 
90 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  56.67 
 
 
91 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  53.85 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  57.3 
 
 
93 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  53.85 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
85 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  56.18 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  57.47 
 
 
87 aa  99  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 
89 aa  96.7  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
87 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  56.04 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  58.33 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  57.47 
 
 
98 aa  94.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 
86 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  58.24 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 
86 aa  94  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  53.93 
 
 
143 aa  94  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  54.65 
 
 
86 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
85 aa  93.6  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 
86 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 
86 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  52.27 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  54.02 
 
 
87 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  55.42 
 
 
84 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 
85 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
98 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  53.93 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  56.47 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 
87 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  52.87 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  52.87 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  63.38 
 
 
86 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  59.76 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  66.2 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 
87 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11799  predicted protein  60.71 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.925205  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0841  ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82493e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 
85 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>