242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4328 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4328  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1626  hypothetical protein  72.46 
 
 		 305 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2029  hypothetical protein  68.2 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.978666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0861  hypothetical protein  67.43 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0812  hypothetical protein  67.21 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0926  hypothetical protein  67.43 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  67.97 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4159  hypothetical protein  66.89 
 
 		 305 aa  391  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1336  hypothetical protein  68.2 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2708  hypothetical protein  54.52 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0708  hypothetical protein  52.77 
 
 		 302 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  45.42 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  43.31 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  42.36 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  42.99 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  43.31 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  41.96 
 
 		 315 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  41.67 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  43.31 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  43.31 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  42.68 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  42.68 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  42.36 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  42.36 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  42.68 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  42.68 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  42.68 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  42.68 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  42.68 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0668  hypothetical protein  42.04 
 
 		 319 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  45.81 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  42.04 
 
 		 307 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  42.81 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  43.13 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  42.48 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  44.13 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  41.67 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  43.79 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  40.52 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1079  hypothetical protein  41.19 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  38.76 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  38.02 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  39.86 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  38.91 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  39.93 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  38.59 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  38.59 
 
 		 287 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  38.59 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  38.59 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  37.42 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  36.6 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  37.58 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  38.73 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  39.48 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  35.62 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  36.45 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  38.26 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  37.3 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  35.99 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  37.46 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  38.69 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  38.69 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  37.63 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  37.63 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  37.7 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  37.28 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  41.18 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  36.69 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  36.48 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  37.83 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  36.98 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  36.98 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  35.2 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  36.98 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  35.51 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  36.98 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  38.03 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  36.66 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  33.44 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  39.48 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  39.48 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  33.66 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  36.07 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  36.07 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  35.62 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  35.29 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  36.3 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  36.07 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  33.66 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  37.85 
 
 		 291 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  35.39 
 
 		 287 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  34.74 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  35.06 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  35.5 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  36.07 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  35.14 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  35.5 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>