242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1079 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1079  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  621  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  49.84 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  49.53 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  50.16 
 
 		 311 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  49.06 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  48.75 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0668  hypothetical protein  46.98 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  47.17 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  47.17 
 
 		 327 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  47.17 
 
 		 327 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  46.54 
 
 		 336 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  45.08 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  46.84 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  46.84 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  46.84 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  46.84 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  46.84 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  46.84 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  46.84 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  46.03 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  45.25 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  46.52 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  45.4 
 
 		 307 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  45.4 
 
 		 307 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  46.6 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  44.01 
 
 		 288 aa  235  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  41.75 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  42.39 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2708  hypothetical protein  44.27 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0861  hypothetical protein  41.99 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0926  hypothetical protein  41.67 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2029  hypothetical protein  41.99 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.978666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  44.34 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0812  hypothetical protein  40.31 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4328  hypothetical protein  41.38 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  40.62 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1626  hypothetical protein  38.41 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117242  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0708  hypothetical protein  42.49 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  40.45 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1336  hypothetical protein  39.68 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4159  hypothetical protein  39.68 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  37.54 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  37.54 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  39.03 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  37.22 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  37.54 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  36.89 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  36.89 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  37.42 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  36.89 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  36.89 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  35.6 
 
 		 287 aa  179  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  37.22 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  37.22 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  37.22 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  37.22 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  38.59 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  38.39 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  38.39 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  39.3 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  38.39 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  39.3 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  37.1 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  39.3 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  36.89 
 
 		 288 aa  175  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  36.25 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  38.19 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  36.1 
 
 		 288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  35.28 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  36.77 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  35.92 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  38.06 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  38.06 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  38.06 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  37.5 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  38.39 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  38.06 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  38.06 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  38.06 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  38.06 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  37.86 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  37.86 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  38.71 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  35.48 
 
 		 290 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  35.6 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  37.99 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  38.71 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  38.19 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  37.86 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  37.86 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  37.1 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  38.83 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  37.1 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  38.83 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  37.1 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  37.1 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  37.1 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  36.77 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  36.74 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  36.89 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>