242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2029 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2029  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.978666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0861  hypothetical protein  75.5 
 
 		 302 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0926  hypothetical protein  75.17 
 
 		 302 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1626  hypothetical protein  70.49 
 
 		 305 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4159  hypothetical protein  70.16 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  72.28 
 
 		 303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4328  hypothetical protein  68.2 
 
 		 304 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0812  hypothetical protein  67.21 
 
 		 305 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1336  hypothetical protein  66.89 
 
 		 323 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2708  hypothetical protein  58.44 
 
 		 307 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0708  hypothetical protein  54.75 
 
 		 302 aa  278  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  43.77 
 
 		 315 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  43.77 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0668  hypothetical protein  42.63 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  44.87 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  44.9 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  45.39 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  44.87 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  44.9 
 
 		 327 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  44.9 
 
 		 327 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  44.55 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  44.55 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  44.55 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  44.55 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  44.55 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  44.55 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  44.55 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  43.13 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  44.27 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  44.27 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  44.19 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  44.19 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  43.93 
 
 		 311 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  42.99 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  45.42 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  42.06 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  43.42 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  41.04 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  43 
 
 		 288 aa  202  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1079  hypothetical protein  41.99 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  39.61 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  36.99 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  38.64 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  38.96 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  38.96 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  37.91 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  38.31 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  37.25 
 
 		 287 aa  169  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  38.56 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  38.76 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  37.66 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  37.91 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  37.99 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  37.99 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  37.99 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  37.99 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  37.99 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  37.99 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  34.81 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  34.87 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  35.83 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  37.95 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  34.08 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  36.27 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  37.66 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  38.76 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  35.5 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  34.3 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  38.66 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  35.39 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  38.76 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  37.22 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  35.81 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  35.05 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  34.7 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  34.54 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  37.58 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  37.01 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  32.57 
 
 		 288 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  37.17 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  34.38 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  35.48 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  36.69 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  37.38 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  36.08 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  36.96 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  36.93 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  37.29 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  37.29 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  37.62 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  36.83 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  33.87 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  33.87 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  33.87 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  33.87 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  33.87 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  33.87 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  33.77 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  33.87 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>