242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0708 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2708  hypothetical protein  64.5 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  58.36 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0812  hypothetical protein  54.07 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4159  hypothetical protein  57.74 
 
 		 305 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0861  hypothetical protein  55.16 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0926  hypothetical protein  55.16 
 
 		 302 aa  301  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1626  hypothetical protein  53.09 
 
 		 305 aa  298  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2029  hypothetical protein  54.72 
 
 		 302 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.978666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4328  hypothetical protein  52.77 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1336  hypothetical protein  53.09 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  43.55 
 
 		 307 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  44.69 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  43.55 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  44.48 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  44.37 
 
 		 311 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  43.83 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  44.37 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  43.83 
 
 		 327 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0668  hypothetical protein  42.9 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  43.83 
 
 		 327 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  44.81 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  44.81 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  45.16 
 
 		 307 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  44.81 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  44.81 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  44.81 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  44.81 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  44.81 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  45.02 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  43.83 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  43.83 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  43.87 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  43.83 
 
 		 336 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  43.23 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  42.12 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  42.58 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  44.92 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  41.64 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1079  hypothetical protein  40.89 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  36.98 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  38.56 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  38.56 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  33.97 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  38.31 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  38.24 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  36.72 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  38.24 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  33.44 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  38.39 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  35.86 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  34.2 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  35.86 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  36.18 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  36.93 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  35.83 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  31.75 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  33.12 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  35.39 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  35.06 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  33.55 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  34.08 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  34.63 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  32.9 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  34.3 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  35.33 
 
 		 309 aa  148  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  34.85 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  36.72 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  31.82 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  32.79 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  34.32 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  37.42 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  34.94 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  33.23 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  28.57 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  33.55 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  39.44 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  33.55 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  38.21 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  31.49 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  34.85 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  34.85 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  33.55 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  33.12 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  34.63 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  33.67 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  34.53 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  33.98 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  33.23 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  30.19 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  30.19 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  30.19 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>