247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2703 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2703  transposase  100 
 
 		 497 aa  1012    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  51.72 
 
 		 497 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  51.52 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  51.52 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  51.52 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  50.81 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  50.81 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  50.81 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  50.81 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  50.81 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  49.7 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  47.39 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  47.18 
 
 		 500 aa  448  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  47.6 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  47.6 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  47.6 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  47.6 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  47.6 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  47.6 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  47.2 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  47.2 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  47.2 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  49.59 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  49.59 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  49.59 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  49.59 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  46.09 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  46.09 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  46.09 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  45.69 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  53.67 
 
 		 383 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  45.08 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  39.87 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  36.62 
 
 		 497 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  40.68 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  37.68 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  37.68 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4444  transposase  44.86 
 
 		 245 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  44.1 
 
 		 226 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  33.01 
 
 		 240 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  33.01 
 
 		 240 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  39.74 
 
 		 159 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  27.2 
 
 		 565 aa  93.6  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  27.2 
 
 		 565 aa  93.6  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  27.2 
 
 		 565 aa  93.6  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  27.2 
 
 		 565 aa  93.6  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3770  putative transposase  46.94 
 
 		 102 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320441  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  28.21 
 
 		 529 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  26.91 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  27.92 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  25.8 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  27.78 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  25.8 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  26.02 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  24.45 
 
 		 584 aa  77  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  27.29 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  27.81 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  27.81 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  27.81 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  27.81 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  25.59 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  25.59 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  27.44 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  27.48 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  26.28 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5004  hypothetical protein  48.48 
 
 		 98 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  23.4 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>