263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4412 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  87.4 
 
 
500 aa  913    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  99.8 
 
 
500 aa  1036    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  99.8 
 
 
500 aa  1036    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  99.8 
 
 
500 aa  1036    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  99.8 
 
 
500 aa  1039    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  99.8 
 
 
500 aa  1039    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  99.8 
 
 
500 aa  1036    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  56.1 
 
 
497 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  99.58 
 
 
240 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4444  transposase  100 
 
 
245 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  99.58 
 
 
240 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  99.1 
 
 
226 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  42.74 
 
 
488 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  41.73 
 
 
505 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  41.25 
 
 
497 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  40.44 
 
 
497 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  40.44 
 
 
497 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  40.44 
 
 
497 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  41.05 
 
 
504 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  40.2 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  40.2 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  40.2 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  40.2 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  40.2 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  40.59 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  40.59 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  40.59 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 
500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  38.91 
 
 
509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  38.91 
 
 
509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 
532 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  39.87 
 
 
497 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  38.51 
 
 
532 aa  332  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  40.52 
 
 
497 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  40.52 
 
 
497 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  40.52 
 
 
497 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  40.52 
 
 
497 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  35.2 
 
 
494 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  35.2 
 
 
494 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  35.2 
 
 
494 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  35.2 
 
 
494 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  35.2 
 
 
494 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  43.9 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 
482 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 
482 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2182  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3770  putative transposase  38.78 
 
 
102 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320441  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  26.15 
 
 
509 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  25.11 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  25.11 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  25.11 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  24.63 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  25.11 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  24.91 
 
 
497 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  24.91 
 
 
497 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  24.91 
 
 
497 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  23.49 
 
 
507 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  24.88 
 
 
565 aa  66.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  24.88 
 
 
565 aa  66.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  24.88 
 
 
565 aa  66.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  24.88 
 
 
565 aa  66.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  32.82 
 
 
159 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  22.51 
 
 
529 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  27.15 
 
 
494 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  27.15 
 
 
494 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  27.15 
 
 
494 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  27.15 
 
 
494 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  27.68 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5004  hypothetical protein  46.97 
 
 
98 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455316  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  26.21 
 
 
584 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  27.68 
 
 
416 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  24.81 
 
 
502 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>