110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4191 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  58.09 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  58.14 
 
 		 504 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  54.42 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  53.28 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  56.4 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  56.4 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  53.28 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  56.4 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  56.4 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  56.4 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  56.4 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  53.28 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  56.1 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  56.1 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  56.1 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  55.2 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  54.34 
 
 		 509 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  54.34 
 
 		 509 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  53.56 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  53.67 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  57.66 
 
 		 497 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  57.66 
 
 		 497 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  57.66 
 
 		 497 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  57.66 
 
 		 497 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  51.01 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  51.01 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  51.01 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  51.01 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  51.01 
 
 		 494 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  45.06 
 
 		 500 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  45.09 
 
 		 497 aa  286  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  43.6 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  43.6 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  46.6 
 
 		 488 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 		 482 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 		 482 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4444  transposase  45.08 
 
 		 245 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  46.08 
 
 		 226 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3770  putative transposase  53.92 
 
 		 102 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320441  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5004  hypothetical protein  43.21 
 
 		 98 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  30.8 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  30.38 
 
 		 534 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  30.38 
 
 		 534 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  30.38 
 
 		 534 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  27.73 
 
 		 565 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  27.73 
 
 		 565 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  27.73 
 
 		 565 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  27.73 
 
 		 565 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  31.13 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  31.13 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  31.13 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  31.13 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  31.13 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  26.16 
 
 		 558 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  26.28 
 
 		 516 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  26.28 
 
 		 516 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  22.79 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  22.79 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  22.79 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  22.79 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  23.01 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  30.77 
 
 		 507 aa  47  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  30.77 
 
 		 500 aa  46.2  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  30.77 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  29.28 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>