87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3141 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  99.17 
 
 
500 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  99.17 
 
 
500 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  99.17 
 
 
500 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  99.17 
 
 
500 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  84.17 
 
 
500 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  51.29 
 
 
497 aa  240  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  38.03 
 
 
488 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  36.05 
 
 
500 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  36.48 
 
 
505 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2182  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 
504 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  36.36 
 
 
504 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  36.36 
 
 
504 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  36.36 
 
 
504 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  36.36 
 
 
504 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  36.36 
 
 
504 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  35.95 
 
 
504 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  35.95 
 
 
504 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  35.95 
 
 
504 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  34.04 
 
 
497 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  35.02 
 
 
504 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  34.04 
 
 
497 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  34.04 
 
 
497 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  34.04 
 
 
497 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  33.05 
 
 
509 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  33.05 
 
 
509 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  33.05 
 
 
532 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  32.19 
 
 
532 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  33.96 
 
 
497 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  33.96 
 
 
497 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  33.96 
 
 
497 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  33.96 
 
 
497 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  33.01 
 
 
497 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  30.8 
 
 
494 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  30.8 
 
 
494 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  30.8 
 
 
494 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  30.8 
 
 
494 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  30.8 
 
 
494 aa  108  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 
482 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 
482 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  31.13 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  28.85 
 
 
501 aa  52  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  33.02 
 
 
497 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  33.02 
 
 
497 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  33.02 
 
 
497 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  25.49 
 
 
507 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3770  putative transposase  32.86 
 
 
102 aa  45.4  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320441  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  29.46 
 
 
510 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  29.46 
 
 
510 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  29.46 
 
 
510 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  29.46 
 
 
510 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  29.36 
 
 
503 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  28.75 
 
 
496 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  28.75 
 
 
496 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  29.41 
 
 
442 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>