185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1786 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  86.32 
 
 
497 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  100 
 
 
497 aa  1028    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  86.32 
 
 
497 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  86.32 
 
 
497 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  56.21 
 
 
497 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  56.21 
 
 
497 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  56.21 
 
 
497 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  56.21 
 
 
497 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  51.72 
 
 
497 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  51.1 
 
 
500 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  50.4 
 
 
494 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  50.4 
 
 
494 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  50.4 
 
 
494 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  50.4 
 
 
494 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  50.4 
 
 
494 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  50.3 
 
 
532 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  49.7 
 
 
532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  48.89 
 
 
505 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  49.5 
 
 
509 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  49.5 
 
 
509 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  49.5 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  49.5 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  49.5 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  49.5 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  49.5 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  49.5 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  49.09 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  49.09 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  49.09 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  48.79 
 
 
504 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  43.12 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  41.25 
 
 
500 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  41.9 
 
 
500 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  55.2 
 
 
383 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  42.74 
 
 
488 aa  352  8.999999999999999e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
482 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 
482 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4444  transposase  47.11 
 
 
245 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  47.58 
 
 
226 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3770  putative transposase  78.43 
 
 
102 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320441  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  34.04 
 
 
240 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  34.04 
 
 
240 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  47.02 
 
 
159 aa  123  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  25.2 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  24.86 
 
 
496 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  24.86 
 
 
496 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  24.59 
 
 
496 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  25.81 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  26.75 
 
 
539 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  25.32 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  25.32 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  25.32 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  25.99 
 
 
556 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  23.51 
 
 
501 aa  67  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  27.04 
 
 
509 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  25.13 
 
 
506 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  25 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
507 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
507 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
507 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>