77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5416 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  100 
 
 
159 aa  320  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  60 
 
 
504 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  57.33 
 
 
532 aa  180  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  59.33 
 
 
500 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  57.72 
 
 
532 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  56 
 
 
509 aa  176  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  56 
 
 
509 aa  176  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  59.33 
 
 
505 aa  174  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  52.5 
 
 
504 aa  170  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  52.5 
 
 
504 aa  170  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  52.5 
 
 
504 aa  170  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  51.88 
 
 
504 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  51.88 
 
 
504 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  51.88 
 
 
504 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  51.88 
 
 
504 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  51.88 
 
 
504 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  51.88 
 
 
504 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  48 
 
 
497 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  48 
 
 
497 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  48 
 
 
497 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 
497 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 
497 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 
497 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 
497 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  47.02 
 
 
497 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  42 
 
 
494 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  42 
 
 
494 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  42 
 
 
494 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  42 
 
 
494 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  42 
 
 
494 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  39.74 
 
 
497 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  32.65 
 
 
497 aa  74.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  32.45 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  30 
 
 
488 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  31.13 
 
 
240 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  31.13 
 
 
500 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  31.13 
 
 
500 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  31.13 
 
 
500 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  31.13 
 
 
240 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  31.13 
 
 
500 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4192  hypothetical protein  46.84 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.223613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  27.74 
 
 
482 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  27.74 
 
 
482 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  34.55 
 
 
488 aa  44.7  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  34.55 
 
 
507 aa  44.3  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  34.55 
 
 
507 aa  44.3  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  34.55 
 
 
507 aa  44.3  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  34.55 
 
 
507 aa  44.3  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>