178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5071 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  69.35 
 
 		 504 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  69.35 
 
 		 504 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  69.35 
 
 		 504 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  69.35 
 
 		 504 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  69.35 
 
 		 504 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  69.25 
 
 		 504 aa  692    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  69.35 
 
 		 504 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 500 aa  1014    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  67.47 
 
 		 505 aa  684    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  70.16 
 
 		 504 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  70.16 
 
 		 504 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  70.16 
 
 		 504 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  72.6 
 
 		 532 aa  712    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  73.4 
 
 		 532 aa  719    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  72.6 
 
 		 509 aa  716    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  72.6 
 
 		 509 aa  716    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  53.23 
 
 		 497 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  53.23 
 
 		 497 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  53.23 
 
 		 497 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  51.1 
 
 		 497 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  53.17 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  53.17 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  53.17 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  53.17 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  47.18 
 
 		 497 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  45.58 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  45.58 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  45.58 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  45.58 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  45.58 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  58.09 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  40.88 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  42.71 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  40.08 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  39.44 
 
 		 500 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  39.18 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  39.18 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4444  transposase  41.39 
 
 		 245 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  59.33 
 
 		 159 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  41.98 
 
 		 226 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  36.05 
 
 		 240 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  36.05 
 
 		 240 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5004  hypothetical protein  68.42 
 
 		 98 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3770  putative transposase  53.92 
 
 		 102 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320441  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  29.14 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  29.14 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  29.14 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  29.14 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  25.5 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  26.18 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  26.18 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  26.18 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  28.12 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  28.67 
 
 		 584 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4192  hypothetical protein  50.67 
 
 		 82 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  25.33 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  25.33 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  25.33 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  25.33 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  24.05 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  24.05 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>