78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4444 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009036  Sbal_4444  transposase  100 
 
 
245 aa  510  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  100 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  99.58 
 
 
500 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  99.1 
 
 
226 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  89.17 
 
 
500 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  59.58 
 
 
497 aa  287  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  47.11 
 
 
497 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  45.08 
 
 
383 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  45.45 
 
 
497 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  45.45 
 
 
497 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  45.45 
 
 
497 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  44.86 
 
 
497 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  44.03 
 
 
505 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  45.27 
 
 
504 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 
488 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  43.21 
 
 
504 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  43.21 
 
 
504 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  43.21 
 
 
504 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  41.56 
 
 
504 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  41.56 
 
 
504 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  41.56 
 
 
504 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  41.56 
 
 
504 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  41.56 
 
 
504 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  41.56 
 
 
504 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  43.97 
 
 
497 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  41.98 
 
 
509 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  41.98 
 
 
509 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  43.97 
 
 
497 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  43.97 
 
 
497 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  43.97 
 
 
497 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  41.39 
 
 
500 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
532 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  41.98 
 
 
532 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  39 
 
 
494 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  39 
 
 
494 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  39 
 
 
494 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  39 
 
 
494 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  39 
 
 
494 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  33.03 
 
 
482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  33.03 
 
 
482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5004  hypothetical protein  46.97 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455316  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  23.83 
 
 
334 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  24.36 
 
 
501 aa  55.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  24.36 
 
 
501 aa  55.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  24.36 
 
 
501 aa  55.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  24.36 
 
 
501 aa  55.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  29.41 
 
 
509 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>