32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4192 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4192  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223613 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  50.67 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  48.75 
 
 		 504 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  45.33 
 
 		 504 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  45.33 
 
 		 504 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  45.33 
 
 		 504 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  45.33 
 
 		 504 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  45.33 
 
 		 504 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  45.33 
 
 		 504 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  45.98 
 
 		 505 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  44.16 
 
 		 532 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  44.16 
 
 		 532 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  46.84 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  42.67 
 
 		 504 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  44.16 
 
 		 509 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  44.16 
 
 		 509 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  42.67 
 
 		 504 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  42.67 
 
 		 504 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  43.9 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  46.58 
 
 		 494 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  46.58 
 
 		 494 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  46.58 
 
 		 494 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  46.58 
 
 		 494 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  46.58 
 
 		 494 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  39.24 
 
 		 497 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  39.24 
 
 		 497 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  39.24 
 
 		 497 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  41.25 
 
 		 497 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 		 497 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 		 497 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 		 497 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 		 497 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>