More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0065 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 482 aa  1001    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 482 aa  1001    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  40.51 
 
 		 497 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  41.55 
 
 		 497 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  41.55 
 
 		 497 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  41.55 
 
 		 497 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  39.37 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  39.37 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  39.37 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  39.37 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  39.37 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 497 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 497 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 497 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  40.29 
 
 		 497 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  39.18 
 
 		 500 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  37.68 
 
 		 497 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  38.28 
 
 		 532 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  38.28 
 
 		 509 aa  291  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  38.28 
 
 		 509 aa  291  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  37.66 
 
 		 532 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  36.61 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  37.77 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  37.76 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  37.77 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  37.77 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  37.77 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  37.77 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  37.77 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  37.77 
 
 		 504 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  37.2 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  37.2 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  37.2 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  33.68 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  41.9 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  32.23 
 
 		 500 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  32.64 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  32.64 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  32.02 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  32.02 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  32.64 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  32.64 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  32.48 
 
 		 500 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4444  transposase  33.03 
 
 		 245 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  32.2 
 
 		 226 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  30.33 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  30.33 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  24.45 
 
 		 529 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  23.76 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  23.76 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  23.76 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  24.62 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  23.64 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  23.52 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  23.78 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  23.78 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  23.63 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  24.02 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  24.17 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  26.48 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>