240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1114 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1114  Transaldolase  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0935  transaldolase  73.18 
 
 		 221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1103  Transaldolase  46.3 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.796809 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14510  predicted protein  38.79 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  32.24 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2813  Transaldolase  42.4 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.060518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  34.98 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  34.98 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  34.98 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  34.58 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  33.49 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0761  putative transaldolase  34.58 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  35.62 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  38.68 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  34.11 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001154  transaldolase  34.55 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000861143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  30.88 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  32.88 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  33.94 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  32.42 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  33.94 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  33.94 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  30.88 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  34.26 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  34.42 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  33.8 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  30.59 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  32.24 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  32.24 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  33.8 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  30.88 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  31.63 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  32.24 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20779  aldolase fructose-6-phosphate-aldolase  35.94 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2640  fructose-6-phosphate aldolase  36.92 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  35.02 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  35.48 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  30.59 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  33.95 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  33.49 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  33.33 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  31.48 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  31.63 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  33.33 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  33.33 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  30.59 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  34.91 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05001  putative fructose-6-phosphate aldolase (FSA)  38.36 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1679  putative translaldolase  30.59 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  35.21 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  32.09 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  30.73 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  31.39 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  33.18 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  31.94 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  32.88 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  35.21 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  31.65 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2019  fructose-6-phosphate aldolase  34.58 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474046  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  29.91 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  32.26 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  31.31 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  31.42 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  34.98 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1908  fructose-6-phosphate aldolase  34.58 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000869598  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0551  putative translaldolase  30.73 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.195885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  30.59 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2241  fructose-6-phosphate aldolase  34.58 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.605165  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  30.7 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  30.84 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  30.56 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  30.14 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3795  Transaldolase  34.09 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.350792  normal  0.5163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  33.02 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  33.95 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  28.97 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  32.71 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  31.67 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  31.46 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  30.94 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  28.97 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0092  Transaldolase  33.65 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0461  putative translaldolase  30.09 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.541779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2390  putative translaldolase  33.96 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  30.28 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2002  putative translaldolase  31.08 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0575  putative translaldolase  30.09 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.267476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  31.6 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4567  putative translaldolase  31.46 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0244923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  31.82 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0859  transaldolase  32.23 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  31.31 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>