More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0473 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  100 
 
 		 223 aa  460  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  62.33 
 
 		 218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  61.86 
 
 		 218 aa  305  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  64.22 
 
 		 217 aa  304  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  64.22 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  63.76 
 
 		 217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  63.72 
 
 		 214 aa  297  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  61.97 
 
 		 221 aa  296  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  63.55 
 
 		 218 aa  295  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  59.15 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  59.52 
 
 		 216 aa  288  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  62.62 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  59.17 
 
 		 217 aa  286  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  59.91 
 
 		 216 aa  286  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  59.35 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  59.91 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  60.66 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  59.72 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  61.11 
 
 		 223 aa  284  8e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  60.09 
 
 		 215 aa  284  8e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  62.09 
 
 		 215 aa  284  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  58.6 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  57.67 
 
 		 215 aa  280  9e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  57.82 
 
 		 214 aa  280  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  58.96 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  61.21 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  57.21 
 
 		 215 aa  279  3e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  60.65 
 
 		 222 aa  277  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  57.35 
 
 		 214 aa  274  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  57.82 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0485  transaldolase  57.82 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  57.35 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  60.38 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  58.8 
 
 		 226 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  60.85 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  59.26 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  54.17 
 
 		 216 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  56.95 
 
 		 223 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4567  putative translaldolase  56.54 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0244923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2002  putative translaldolase  57.08 
 
 		 218 aa  268  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  56.87 
 
 		 217 aa  268  5e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  57.82 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  56.82 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  57.14 
 
 		 217 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  58.8 
 
 		 222 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  59.07 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2088  putative translaldolase  60.19 
 
 		 222 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  57.41 
 
 		 215 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  55.76 
 
 		 217 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  55.45 
 
 		 215 aa  257  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  55.45 
 
 		 215 aa  257  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  55.45 
 
 		 215 aa  257  9e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  55.45 
 
 		 215 aa  257  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  55.45 
 
 		 215 aa  257  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  55.45 
 
 		 215 aa  257  9e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  55.45 
 
 		 215 aa  257  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  55.45 
 
 		 215 aa  257  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  56.5 
 
 		 217 aa  257  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  58.77 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  55.4 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  53.92 
 
 		 218 aa  256  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  51.66 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  55.19 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  54.03 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  58.49 
 
 		 217 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23680  transaldolase  55.31 
 
 		 226 aa  254  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00402875  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  54.03 
 
 		 215 aa  254  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  55.92 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  57.14 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  57.62 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1087  transaldolase  56.36 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000179872  hitchhiker  0.0000000000000152073 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  52.61 
 
 		 213 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  51.18 
 
 		 215 aa  251  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  54.03 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  52.61 
 
 		 213 aa  251  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1679  putative translaldolase  52.83 
 
 		 216 aa  251  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  53.33 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  57.14 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  57.14 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  57.82 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  52.13 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  56.6 
 
 		 217 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  51.43 
 
 		 213 aa  248  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  57.82 
 
 		 217 aa  248  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  55.35 
 
 		 215 aa  248  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  53.05 
 
 		 215 aa  248  7e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  57.35 
 
 		 217 aa  247  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  54.98 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  53.81 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1409  putative translaldolase  54.93 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  57.55 
 
 		 218 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1190  transaldolase-like protein  54.93 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000125483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  56.94 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  55.56 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  52.31 
 
 		 217 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  55.24 
 
 		 217 aa  244  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2390  putative translaldolase  58.1 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  54.46 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  55.24 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  51.87 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>