More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0935 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0935  transaldolase  100 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1114  Transaldolase  73.18 
 
 		 223 aa  287  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1103  Transaldolase  43.93 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.796809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  34.27 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  37.04 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  37.04 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  33.33 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  34.11 
 
 		 215 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  36.57 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  37.85 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  34.27 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  32.86 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  34.11 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14510  predicted protein  38.99 
 
 		 272 aa  131  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  35.98 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  33.64 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  33.64 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0761  putative transaldolase  33.8 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  32.41 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  34.42 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  34.6 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  32.87 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05001  putative fructose-6-phosphate aldolase (FSA)  37.79 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0057  transaldolase  38.86 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  32.39 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  34.42 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  31.78 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  30.88 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  31.02 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  35.05 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0551  putative translaldolase  33.33 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.195885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  32.39 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2813  Transaldolase  40.28 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.060518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  34.58 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001154  transaldolase  34.38 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000861143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  35.07 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  32.24 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  32.24 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  32.09 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  37.67 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  31.63 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  34.6 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  34.88 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  31.94 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  32.87 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  35.02 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  32.23 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  34.25 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  33.18 
 
 		 221 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  29.58 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4567  putative translaldolase  31.05 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0244923  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  31.48 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  31.46 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  31.46 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  30.84 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  33.02 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  32.23 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  33.96 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1216  putative translaldolase  32.09 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000404996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  29.95 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  32.56 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  30.99 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  33.33 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  33.8 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1409  putative translaldolase  32.09 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145663  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1190  transaldolase-like protein  32.09 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000125483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  33.64 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  29.44 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  33.03 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  32.56 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  32.56 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  32.56 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  32.56 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  32.56 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  32.56 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2390  putative translaldolase  33.18 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  32.56 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  34.74 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  30.99 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  31.63 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  32.24 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1454  transaldolase  32.71 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00117574  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  31.65 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  30.99 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  30.84 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0859  transaldolase  31.9 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2640  fructose-6-phosphate aldolase  37.56 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  30.59 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0092  Transaldolase  31.58 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  30.99 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  31.78 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  30.56 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1908  fructose-6-phosphate aldolase  36.53 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000869598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2019  fructose-6-phosphate aldolase  36.53 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2241  fructose-6-phosphate aldolase  36.53 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.605165  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  28.9 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  31.94 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  30.88 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2002  putative translaldolase  31.48 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1807  putative translaldolase  31.28 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>